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技術(shù)文章 / article
【連載-企業(yè)參考品】 前列腺癌的診斷參考品的選擇
原載自:[技術(shù)資料頻道] 2020-10-15 瀏覽次數(shù):1090
科佰生物作為一家提供企業(yè)核酸診斷標(biāo)準(zhǔn)品的企業(yè),在該領(lǐng)域已經(jīng)深耕多年,與全國(guó)該領(lǐng)域90%的企業(yè)都有過(guò)合作,成功支持過(guò)很多企業(yè)的試劑盒研發(fā)和獲批,在該領(lǐng)域有豐富的經(jīng)驗(yàn)。根據(jù)我們對(duì)市場(chǎng)的調(diào)研,對(duì)客戶(hù)需求的理解,我們把我們的產(chǎn)品線(xiàn)劃分為多個(gè)模塊,主要為支持PCR的單點(diǎn)mutation、fusion和CNV產(chǎn)品,支持NGS的小panel和大panel(泛腫瘤、包含TMB和MSI)產(chǎn)品,支持IHC和Fish的FFPE block產(chǎn)品,支持標(biāo)準(zhǔn)品定標(biāo)的dPCR檢測(cè)試劑盒產(chǎn)品等。
接下來(lái)的幾期,我們陸續(xù)會(huì)針對(duì)不用的腫瘤,遵循NCCN指南的標(biāo)注,為大家分享我們對(duì)企業(yè)參考品選擇的看法。
前列腺癌是指發(fā)生在前列腺的上皮性惡性腫瘤。2004年WHO《泌尿系統(tǒng)及男性生殖器官腫瘤病理學(xué)和遺傳學(xué)》中前列腺癌病理類(lèi)型上包括腺癌(腺泡腺癌)、導(dǎo)管腺癌、尿路上皮癌、鱗狀細(xì)胞癌、腺鱗癌。其中前列腺腺癌占95%以上,因此,通常我們所說(shuō)的前列腺癌就是指前列腺腺癌。2012年我國(guó)腫瘤登記地區(qū)前列腺癌發(fā)病率為9.92/10萬(wàn),列男性惡性腫瘤發(fā)病率的第6位。發(fā)病年齡在55歲前處于較低水平,55歲后逐漸升高,發(fā)病率隨著年齡的增長(zhǎng)而增長(zhǎng),高峰年齡是70~80歲。家族遺傳型前列腺癌患者發(fā)病年齡稍早,年齡≤55歲的患者占43%。
針對(duì)前列腺癌的診斷,寫(xiě)入NCCN和專(zhuān)家共識(shí)的主要的還是HRR(homologous recombination repair)基因的胚系和體系突變,另外還有微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(microsatellite instability,MSI)和DNA錯(cuò)配修復(fù)缺陷(DNA mismatch repair deficiency,dMMR)檢測(cè),還有一些未明確的基因。
HRR相關(guān)基因
對(duì)于初診未進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估、極低風(fēng)險(xiǎn)至中風(fēng)險(xiǎn)的前列腺癌患者,其家族史的獲得及遺傳咨詢(xún)是檢測(cè)前的必要步驟:對(duì)于具有明確相關(guān)家族史、已知家族成員攜帶胚系致病基因突變的上述風(fēng)險(xiǎn)級(jí)別患者,推薦進(jìn)行DNA損傷修復(fù)相關(guān) 基因(特別是BRCA2、BRCA1、ATM、PALB2、 CHEK2、MLH1、MSH2、MSH6、PMS2)的胚系變異檢測(cè);對(duì)于家族史不詳?shù)纳鲜鲲L(fēng)險(xiǎn)級(jí)別患者,需要結(jié)合臨床特征進(jìn)行遺傳咨詢(xún)后綜合判斷 是否有必要進(jìn)行相關(guān)檢測(cè)。對(duì)于高風(fēng)險(xiǎn)、*風(fēng)險(xiǎn)、局部進(jìn)展及轉(zhuǎn)移性前列腺癌患者,推薦進(jìn)行DNA修復(fù)基因(特別是BRCA2、BRCA1、ATM、 PALB2、CHEK2、MLH1、MSH2、MSH6、 PMS2)的胚系變異檢測(cè)。
針對(duì)HRR相關(guān)的基因,科佰生物推出多款相關(guān)的標(biāo)準(zhǔn)品:
錯(cuò)配修復(fù)基因
回顧性研究發(fā)現(xiàn),錯(cuò)配修復(fù)基因突變型前列腺癌患者的臨床和病理學(xué)特征更具侵襲性。國(guó)外研究報(bào)道,前列腺癌患者中dMMR及MSI-H患者 比例為2%~5%。另有研究報(bào)道,約3%的前列腺癌 患者攜帶MSH2(2%)、MLH1(1%)、MSH6(1%)及PMS2(<1%)基因體細(xì)胞變異,攜帶上述基因突變的患者往往具有很高的總體基因突變數(shù)量。在中 國(guó)316例前列腺癌患者中,攜帶MSH6、MSH2基因 胚系致病變異的患者比例均為0.63%,未發(fā)現(xiàn)攜帶 MLH1、PMS2基因胚系致病變異的患者。
《NCCN指南》推薦局部進(jìn)展、轉(zhuǎn)移性及mCRPC患者進(jìn)行MSI-H及dMMR檢測(cè),如確診為MSI-H或dMMR型,mCRPC患者可在特定治療階段考慮pembrolizumab治療(2B類(lèi)),同時(shí)需要進(jìn)行遺傳咨詢(xún)及考慮林奇綜合征(Lynch syndrome)的相關(guān)基因檢測(cè),進(jìn)一步的MMR基因胚系變異檢測(cè)可以明確其遺傳性改變規(guī)律。
科佰基因推出多對(duì)MSI的檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)品:
其他基因
HOXB13基因:《費(fèi)城共識(shí)》提出需要對(duì)與遺傳性前列腺癌相關(guān)的HOXB13基因進(jìn)行檢測(cè)(共識(shí) 率95%),主要突變?yōu)镚84E和G135E。
RB1基因:近期多項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),RB1基因突變或缺失對(duì)mCRPC患者具有重要的預(yù)后預(yù)測(cè)價(jià)值,在mCRPC中,RB1基因突變或缺失與更差的生存期及阿比特龍或恩雜魯胺更短的治療時(shí)間有關(guān)。
AR基因:AR基因擴(kuò)增/配體結(jié)構(gòu)域變異(比如AR-V7)也與前列腺癌阿比特龍及恩雜魯胺敏感性降低相關(guān)。
TP53基因:TP53突變也與前列腺癌阿比特龍及恩雜魯胺敏感性降低相關(guān)。
FOXA1基因:FOXA1是與AR受體通路相關(guān)的重要基因,F(xiàn)OXA1高表達(dá)與前列腺癌的不良預(yù)后相關(guān)。近的一項(xiàng)對(duì)208例局限期前列腺癌患者的研究發(fā)現(xiàn),41%的中國(guó)患者攜帶FOXA1突變,遠(yuǎn)高于既往西方發(fā)達(dá)國(guó)家患者的比例。并且中國(guó)患者FOXA1突變絕大部分為熱點(diǎn)突變,可能通過(guò)調(diào)節(jié)AR通路促進(jìn)前列腺癌的發(fā)生、發(fā)展。
這些基因相關(guān)的標(biāo)準(zhǔn)品,我們都在開(kāi)發(fā)中,歡迎咨詢(xún)…
綜上,按照NCCN的指南,按照臨床的藥物,按照伴隨診斷的需求,科佰生物開(kāi)發(fā)了針對(duì)前列腺癌的各種參考品、標(biāo)準(zhǔn)品,適合不同的應(yīng)用,滿(mǎn)足不同客戶(hù)的需求。
標(biāo)準(zhǔn)品選擇好了,接下來(lái)就是做性能評(píng)價(jià),讓我們先學(xué)習(xí)下指導(dǎo)原則,對(duì)于性能評(píng)價(jià)的規(guī)定。
詳見(jiàn)《從《指導(dǎo)原則》中分析參考品盤(pán)設(shè)計(jì)》。