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技術(shù)文章 / article
【產(chǎn)品推介】MSI標準品
原載自:[技術(shù)資料頻道] 2021-04-01 瀏覽次數(shù):1875
微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(Microsatellite Instability,MSI),是指由于在DNA復(fù)制時插入或缺失突變引起的微衛(wèi)星(Microsatellite,MS)序列長度改變的現(xiàn)象,常由錯配修復(fù)功能(Mismatch repair,MMR)缺陷引起。MS序列,是一些短而重復(fù)的DNA序列,一般由1~6個核苷酸組成,串聯(lián)重復(fù)排列,常見類型為雙堿基CA/GA/GT或單堿基A/T等。MS序列可以位于基因的重要非編碼區(qū),也可以位于基因的編碼區(qū),多態(tài)性分布于整個基因組,個體差異大。MSI現(xiàn)象于1993年被Jacobs等人在結(jié)直腸癌中*發(fā)現(xiàn),與癌癥發(fā)生有關(guān),可以用于癌癥檢測。
MSI檢測方法
MSI常由MMR基因突變及功能缺失導(dǎo)致。因此,在檢測癌細胞中的MSI時,既可以通過檢測MMR基因缺失來確定是否發(fā)生MSI,如依賴于免疫組化技術(shù)的蛋白水平檢測,也可以直接檢測MSI的序列變化,如PCR(聚合酶鏈反應(yīng))檢測等的分子水平檢測。
(一)免疫組化方法
免疫組化方法(Immunohistochemistry, IHC):采用免疫組織化學(xué)方法檢測腫瘤組織中錯配修復(fù)基因MLH1、MSH2、MSH6及PMS2的表達。任何一項錯配修復(fù)基因表達缺失,被定義為MSI,否則即為微衛(wèi)星穩(wěn)定(MSS)。其中一個表達缺失則稱為低度微衛(wèi)星不穩(wěn)定(MSI-L),2種或2種以上蛋白表達缺失為高度微衛(wèi)星不穩(wěn)定(MSI-H)。
(二)分子水平的檢測
1.聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction, PCR)技術(shù)
目前主要采用多重?zé)晒釶CR結(jié)合毛細管電泳的方法。通過PCR方法檢測特異的微衛(wèi)星重復(fù)序列擴增判定MSI狀態(tài),比較腫瘤患者的標本組織與正常組織的位點突變情況。其比較的位點為美國國家癌癥研究所(NCI)推薦的5個微衛(wèi)星位點:BAT25、BAT26、D5S346、D2S123及D17S250。其中≥2個位點發(fā)生改變判定為高度微衛(wèi)星不穩(wěn)定(MSI-H),僅1個位點發(fā)生改變判定為低度微衛(wèi)星不穩(wěn)定(MSI-L),無位點改變判定為微衛(wèi)星穩(wěn)定(MSS)。有研究認為,二核苷酸重復(fù)序列的特異性和靈敏度比單核苷酸重復(fù)序列要低,因此關(guān)于MSI檢測的位點仍存在爭議。Bacher等對266個微衛(wèi)星位點(其中包括單核苷酸、二核苷酸、四核苷酸以及五核苷酸微衛(wèi)星位點)檢測的敏感性及準確性進行評估,提出了Promega分析系統(tǒng),該系統(tǒng)使用五個單核苷酸微衛(wèi)星位點(BAT-25, BAT-26, NR-21, NR-24和MONO-27)及兩個五核苷酸微衛(wèi)星位點(Penta C和Penta D)檢測MSI。大量的實驗證實,MMR免疫組化檢測結(jié)果與MS的PCR檢測結(jié)果有高度關(guān)聯(lián)性,靈敏度92%,特異性可達100%。
2.新一代測序方法(Next Generation Sequencing, NGS)
NGS又稱為第二代測序技術(shù),是一種高通量測序技術(shù),能一次性對幾十萬到幾百萬條基因分子進行序列測定。目前NGS方法已經(jīng)成為檢測MSI的新工具,其優(yōu)勢是可以實現(xiàn)多位點高通量檢測。紀念斯隆·凱特琳癌癥研究中心(Memorial Sloan Kettering Cancer Center,MSK)的一項研究使用NGS方法對12,288例實體瘤病人進行檢測,判定MSI狀態(tài),并用MSI-PCR/MMR-IHC進行了驗證。實驗證明, NGS方法較MSI-PCR方法具有更高的敏感性。
科佰生物可以提供MSI的診斷標準品,保證診斷方法的檢測限、靈敏度、穩(wěn)定性。
MSS-P1(1.92%) Reference Standard CBP80002-1
MSS-P2 Reference Standard CBP80002-2
MSS-P3 Reference Standard CBP80002-3
MSS-P4(1.92%) Reference Standard CBP80002-4
MSI-H-U1(100%) Reference Standard CBP80002-5
MSI-H-U2(98.08%) Reference Standard CBP80002-6
MSI-H-U3 Reference Standard CBP80002-7
MSI-H-U4(90.38% Reference Standard
CBP80002-8
MSI-H-U5(94.23%) Reference Standard CBP80002-9
MSI-H-U6 Reference Standard CBP80002-10
MSI-H-U7 Reference Standard CBP80002-11
MSI-H-U8 Reference Standard CBP80002-12